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巴氏染色液是如何應用的，先將固定后的涂片入水、蘇木精染核、鹽酸酒精分化、返藍同HE染色。70％、80％、95％酒精逐級脫水各：1分鐘。橙黃-G6 3-5分鐘。95％酒精I、Ⅱ缸洗各1分鐘。EA36或EA50 5分鐘。95％酒精I、II缸洗各1分鐘。無水酒精I、Ⅱ缸洗各1分鐘。二甲苯I、Ⅱ缸透明各1。中性樹膠封固。

巴氏染色法將胞核染為深藍色；鱗狀上皮底層、中層及表層角化前細胞胞質染綠色，表層不全角化細胞胞質染粉紅色，完全角化細胞胞質呈桔黃*色；高分化鱗癌細胞可染成粉紅色或桔黃*色；腺癌胞質呈灰藍色；中性粒細胞和淋巴細胞、吞噬細胞胞質均為藍色；紅細胞染粉紅色，粘液染成淡藍色或粉紅色。

巴氏染色液特點，細胞透明度好，結構清晰，涂片色彩豐富而鮮艷，由于能顯示鱗狀上皮不同角化程度，常用于陰道涂片測定雌激素水平。宮頸涂片和痰涂片中分化差的鱗癌小角化細胞顯示桔黃*色，在紅色壞死背景中特別突出，不易漏診。